A második világháború megállította az Ágyúsokat a menetelésben, de Tom Whittaker lett az új menedzser és újabb sikerek következtek. Az Arsenal bajnok lett az 1947/1948 és az 1952/1953-as szezonban, FA Kupát nyert 1950-ben és második lett 1952-ben. A 60-as évek kevesebb sikert hoztak a trófeák szerzése terén, két elvesztett találkozót említhetünk meg a Liga Kupa döntőjében 1968 és 1969-ben. Bertie Mee a 60-as évek közepén vette át a csapatot és az Arsenal 1969/1970-es szezonra ért be, amikor is megnyerte az első európai trófeát legyőzve az Anderlechtet 4-3-ra a két fordulós Fairs Cup döntőben.

A folytatás még ennél is jobb volt a következő szezonban. Az Arsenal csapata olyan játékosokat tudhatott soraiban, mint Charlie George, George Armstrong, Ray Kennedy és a kapitány McLintock, megnyerték a bajnoki címet és az FA Kupát ugyanabban az évben. Megszerezték a White Hart Lane címet, amikor a ráadásban a Wembley-ben legyőzték a Liverpool együttesét és ezzel elnyerték a kupát. A csapat három egymás utáni évben képviseltette magát a Wembley stadionba az FA Kupa döntő keretében Terry Neill irányításával. A másodikat is megnyerték 3-2-es győzelemmel a Manchester United felett. A mérkőzést "Öt perces döntőként" emlegették. Az Ágyúsok 1980-ban eljutottak a Kupagyőztesek Kupája döntőjébe, azzal a csapattal, mely a következő játékosokat tudhatta sorai közt: Graham Rix, Frank Stapleton, Pat Rice, David O'Leary és Liam Brady, de elvesztették a büntetőpárbajt a Valencia-val szemben. Georg Graham

1986-ban George Graham, tagja az 1971-es duplázó csapatnak, átvette a menedzserséget Dan Howe-tól és dicsőséges napok következtek. Az Arsenal megszerezte első Liga Kupa győzelmét 1986/67-ben, legyőzve a Liverpoolt 2-1-re a döntőben. Két évvel később megnyerték a League Championship-et, a híres utolsó perces góljával Michael Thomas-nak megszerezve a címet a 2-0-s győzelemmel az Anfielden. Egy újabb cím következett 1990/91-ben, amikor a csapat magáénak tudhatta a legjobb védekező alakzatot, így csak egy bajnoki mérkőzést vesztettek el az egész szezon folyamán.

Több trófea is következett. 1992/93-ban az Arsenal lett az első klub aki ugyanabban az évben mindkét hazai kupát megnyerte. A Sheffield Wednesday volt a legyőzött fél mindkét sorozatban. A Graham éra sikerei a következő szezonban kiteljesedtek. A remek menetelés a Kupagyőztesek Európa Kupájában egy emlékezetes 1-0-s győzelemmel zárult a Parma felett a koppenhágai döntőben, Alan Smith csatárnak köszönhetően. Az Arsenal nem tudta megvédeni címét a következő szezonban, az 1995-ös döntőben vereséget szenvedett a Real Zaragozaval szemben. Ez idő alatt George Graham elhagyta a klubot. Bruce Rioch vette át a helyét, aki azonban csak egy szezont töltött a csapatnál, de ez idő alatt leigazolta Dennis Bergkamp-ot.